First nosocomial outbreak of SME-4-producing Serratia marcescens in South America / Primer brote nosocomial por Serratia marcescens productora de SME-4en Sudamérica

Abstract Carbapenemase-producing-Serratia marcescens isolates, although infrequent, are considered important nosocomial pathogens due to their intrinsic resistance to polymyxins, which limits therapeutic options. We describe a nosocomial outbreak of SME-4-producing S. marcescens in Buenos Aires city which, in our knowledge, represents the first one in South America.

Resumen Los aislamientos de origen nosocomial de Serratia marcescens productores de car-bapenemasa, si bien son infrecuentes, son considerados importantes patógenos debido a su resistencia intrínseca a las polimixinas, lo cual limita aún más las opciones terapéuticas. En este trabajo se describe un brote nosocomial causado por S. marcescens portadora de car-bapenemasa de tipo SME-4 en la Ciudad de Buenos Aires, el cual representaría el primero en Sudamérica.

Microorganismos productores de carbapenemasa en muestras clínicas de pacientes internados en el hospital de clínicas durante los años 2020-2021

La Organización Mundial de la Salud ha declarado que la resistencia a los antimicrobianos es una de las 10 principales amenazas de salud pública a las que se enfrenta la humanidad. Actualmente, enzimas de las familias Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC), Oxacillinase (OXA), New Delhi Metallo-beta-lactamase (NDM), Verona Integron En coded Metallo-beta-lactamase (VIM) e Imipenemase (IMP) son las que se detectan con mayor frecuencia a nivel mundial. El objetivo es describir los hallazgos de los aislamientos de microorganismos productores de carbapenemasas de pacientes internados en el Hospital de Clínicas durante los años 2020 y 2021. Se realizó un estudio descriptivo retrospectivo de corte transversal de datos obtenidos del laboratorio de microbiología del Hospital entre enero 2020 y diciembre 2021. Se estudiaron 216 muestras clínicas de las cuales 196(91%) fueron en pacientes adultos, 172 (80%) fueron positivos para enzimas metalo-ß-lactamasa (MBL), Klebsiella pneumoniae fue la especie más frecuente. En pacientes internados en la Unidad de Cuidados Intensivos predominaron estos aislamientos y en muestras de orina 91 (42%). Según sexo, 108(50%) para ambos sexos y una mediana de edad de 52 años, con un rango de 6 días de vida a 92 años. En cuanto a número de aislamientos hallados, fue mayor en el año 2020 con 121 (56%).La vigilancia activa junto a medidas de control de infecciones son necesarias para limitar la diseminación de microorganismos productores de carbapenemasas, además se hallan datos necesarios para justificar la introducción al país de antibióticos de elección para estos microorganismos.

The World Health Organization has declared antimicrobial resistance one of the top 10 public health threats facing humanity. Currently, enzymes from the families Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC), Oxacillinase (OXA), New Delhi Metallo-beta-lactamase (NDM), Verona Integron En coded Metallo-beta-lactamase (VIM) and Imipenemase (IMP) are those that are more frequently detected worldwide. The objective is to describe the findings of the isolates of carbapenemase-producing microorganisms from patients hospitalized at the Hospital de Clínicas during the years 2020 and 2021. A retrospective descriptive cross-sectional study of data obtained from the Hospital's microbiology laboratory was carried out between January 2020and December 2021. 216 clinical samples were studied, of which 196 (91%) were in adult patients, 172 (80%) were positive for metallo-ß-lactamase (MBL) enzymes, Klebsiella pneumoniae was the most frequent species. In patients hospitalized in the Intensive Care Unit these isolates predominated and in urine samples 91 (42%). According to sex, 108 (50%) for both sexes and a median age of 52 years, with a range of 6 days to 92 years. Regarding the number of isolates found, it was higher in 2020 with 121 (56%). Active surveillance together with infection control measures are necessary to limit the spread of carbapenemase-producing microorganisms, in addition, there are necessary data to justify the introduction of antibiotics of choice for these microorganisms into the country.

Caracterización fenotípica y molecular de cepas de Klebsiella pneumoniae productores de carbapenemasas tipo OXA-48 circulantes en Chile

Introducción: La aparición y diseminación de Enterobacterales resistentes a carbapenémicos ha generado un gran impacto en las infecciones asociadas a la atención de salud en el mundo. Recientemente, en Chile se detectó un brote por Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasas tipo oxacilinasas (OXA) de la subfamilia tipo OXA-48, reportándose los primeros casos en pacientes hospitalizados mayoritariamente en la zona norte del país. Objetivo: Determinar los perfiles fenotípicos, genotípicos y de susceptibilidad antimicrobiana de 16 cepas referidas durante mayo del año 2021 desde las regiones de Antofagasta y Metropolitana al Laboratorio de Referencia del Instituto de Salud Pública. Metodología: Las cepas provenientes de muestras clínicas fueron analizadas mediante técnicas tradicionales (Kirby-Bauer y epsilometría) y automatizadas, además de técnicas colorimétricas, inmunocromatográficas y moleculares (RPC y PFGE). Resultados: Se detectó la presencia de los genes blaoxa-48 y blaoxa-232 con una resistencia inusual, tanto a carbapenémicos (ertapenem, imipenem y meropenem) como a cefalosporinas (cefepime, cefotaxima y ceftazidima), además de piperacilina/tazobactam y temocilina. Se detectaron dos subtipos por PFGE, siendo predominante el clon CL-Kpn-Spe-329 (93,8%) con dos mecanismos de resistencia identificados: carbapenemasa y β-lactamasa de espectro extendido (BLEE). Conclusión: Ante esta alerta epidemiológica es necesario unificar criterios existentes en la red asistencial nacional para la oportuna detección, vigilancia y control de posibles brotes de cepas productores de oxacilinasa tipo OXA-48.

Background: The appearance and spread of carbapenems-resistant Enterobacterales have generated a major impact on health care-associated infections worldwide. Recently, a Klebsiella pneumoniae outbreak expressing OXA-48 like-carbapenemases was detected in Chile, the first reported cases corresponded to hospitalized patients mainly from northern Chile. Aim: To characterize the phenotypic and genotypic profiles of antimicrobial susceptibility of 16 clinical isolates referred during May 2021 from Antofagasta and Metropolitan regions to the Reference Laboratory of Instituto de Salud Publica. Methods: Antimicrobial susceptibility of all strains was analyzed using traditional (Kirby-Bauer and epsilometry) and automated methods, and complemented with colorimetric, immunochromatographic and molecular (PCR and PFGE) techniques. Results: As a result of the genetic characterization, blaoxa-48 and blaoxa-232 genes were detected, showing the isolates an unusual resistance profile to both carbapenems (ertapenem, imipenem, and meropenem) and cephalosporins (cefepime, cefotaxime, and ceftazidine), as well as piperacillin/ tazobactam and temocillin. Two subtypes were detected by PFGE, with a predominant clone CL-Kpn-Spe-329 (93.8%), with two resistance mechanisms identified: carbapenemase and extended-spectrum β-lactamase (ESBL). Conclusion: Due to this epidemiological alert, it is essential the establishment of national guidelines for early detection, surveillance, and control of future outbreaks of OXA-48 like carbapenemases isolates.

Primeros aislados de Enterobacter cloacae complex co-productores de KPC y NDM en un hospital de segundo nivel en la Cuidad de Panamá / First isolates of Enterobacter cloacae complex co-producing KPC and NDM in a second level hospital in City of Panama

Resumen La aparición de Enterobacterales co-productores de dos o más carbapenemasas han despertado las alertas sanitarias en Latinoamérica. Las enterobacterias co-productoras de carbapenemasas KPC y NDM-1 son resistentes a casi todos los antibacterianos existentes. Panamá ha reportado la presencia de carbapenemasas KPC desde 2010 y NDM desde 2011; sin embargo, Enterobacterales con doble producción de carbapenemasas es un fenómeno reciente en nuestros hospitales. Presentamos los dos primeros aislados de Enterobacter cloacae complex co-productores de KPC y NDM, en un hospital de segundo nivel de la Ciudad de Panamá. El reforzamiento de los sistemas de vigilancia epidemiológica en los hospitales permite realizar una detección oportuna de estas nuevas combinaciones de mecanismos de resistencia; para así, implementar medidas de prevención y control de brotes.

Abstract Enterobacterales co-producing carbapenemases have awakened health alerts in Latin America. Carbapenemase-producing Enterobacterales harboring KPC and NDM-1 are resistant to almost all existing antibiotics. Panama reports KPC since 2010, and NDM since 2011, however, Enterobacterales with double carbapenemase production is new to our hospitals. We present the first two isolates of Enterobacter cloacae complex co-producing KPC and NDM, in a second level hospital in Panama City. Strengthening epidemiological surveillance systems in hospitals allows to carry out timely detection of these new combinations of resistance; to implement outbreak prevention and control measures.

First Clinical Cases of OXA-48-Producing Klebsiella pneumoniae in Peru / Primeros casos clínicos de infecciones por Klebsiella pneumoniae productora de OXA-48 en Perú

Background: Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae(CPE) represents a global public health concern and systemic infectionsassociatedwithOXA-48 carbapenemase are increasingly being reported in Latin America. Here, we present the first 2 cases of systemic infections by OXA-48-ProducingKlebsiellapneumoniaein Peru. A favorable clinical response was observed after targeted treatment with colistin as a backbone.

Introducción: Las enterobacterias productoras de carbapenemasas (EPC) representan un problema de salud pública y cada vez hay más reportes de infecciones sistémicas asociadas con la carbapenemasa OXA-48 en America Latina. Presentamos los primeros 2 casos de infecciones sistémicas por Klebsiella pneumoniae productora de OXA-48 en Perú. Se observó una respuesta clínica favorable luego del tratamiento dirigido con colistina como base.

Tipos de carbapenemasas expresadas en Klebsiella spp, y Pseudomonas aeruginosa resistente a carbapenémicos en seis hospitales de alta complejidad de la Ciudad de Bogotá - Colombia / Carbapenemases produced in Klebsiella spp, and Pseudomonas aeruginosa in six hospitals in Bogotá - Colombia

INTRODUCCIÓN: En las últimas décadas, se ha incrementado la prevalencia de infecciones por bacilos gramnegativos resistentes a carbapenémicos. OBJETIVO: Determinar los tipos y la frecuencia de las distintas carbapenemasas en aislados de Klebsiella spp. y Pseudomonas aeruginosa, en seis hospitales de alta complejidad de Bogotá-Colombia. MÉTODOS: Estudio observacional descriptivo en seis hospitales de la ciudad de Bogotá, en el período de enero de 2017 a agosto de 2018. Se realizaron RPC para genes de KPC, GES, VIM, NDM, IMP y OXA-48 en cepas de Klebsiella spp y P aeruginosa resistentes a carbapenémicos. RESULTADOS: 52 aislados de P aeruginosa amplificaron para una carbapenemasa, de los cuales 39 (75%) fueron positivos para KPC, 11 (21%) para VIM y 2 co-producciones de KPC y VIM. En cuanto a Klebsiella spp., 165 cepas amplificaron al menos para una carbapenemasa, 98% expresaron KPC y 4 aislados tuvieron co-producciones de metalo-beta-lactamasas y KPC. DISCUSIÓN: Este estudio aporta información valiosa, como el incremento de producción de KPC en P. aeruginosa y la co-producción de KPC y metalo-beta-lactamasas, locual tiene una implicancia tanto en la selección del tratamiento, las medidas de aislamiento de contacto y el pronóstico de los pacientes.

BACKGROUND: In the last decades, the prevalence of infections by carbapenem resistant gram-negative bacilli has been increased. OBJECTIVE: To determine types and frequency of the different carbapenemases in Klebsiella spp. and Pseudomonas aeruginosa, in six hospitals in Bogotá-Colombia. METHODS: Descriptive and observational study, in six hospitals in the city of Bogotá, in the period ftom January 2017 to August 2018. PCR were performed for KPC, GES, VIM, NDM, IMP and OXA-48 genes, in carbapenem resistant Klebsiella spp. and P aeruginosa. RESULTS: 52 P aeruginosa isolates amplified a carbapenemase gene, of which 39 (75%) were positive for KPC, 11 (21%) for VIM and two co-productions of KPC and VIM. Regarding Klebsiella spp. 165 strains amplified at least one carbapenemase gene, 98% expressed KPC and four isolates had co-productions of metallo-P-lactamases and KPC. DISCUSSION: This study provides valuable information, such as the increased production of KPC in P. aeruginosa información valiosa, como el incremento de producción de KPC en P. aeruginosa and the co-production of KPC plus metallobetalactamases, which has an implication both in treatment selection, isolation precautions and patient prognosisy.

Colonización rectal por Enterobacterales productores de múltiples carbapenemasas: Reporte de un caso de coproducción / Rectal colonization by Enterobacterales producing multiple carbapenemases: a co-production case report

Resumen El constante aumento de Enterobacterales productores de carbapenemasas (CPE) se constituye en un problema de salud pública a nivel mundial, por el impacto generado en la mortalidad de los pacientes. El tracto gastrointestinal es el principal reservorio de este tipo de microorganismos, por lo cual, la colonización rectal se convierte en un importante factor de riesgo para el desarrollo de posteriores infecciones. Una de las estrategias de vigilancia epidemiológica activa, es la búsqueda de pacientes colonizados, a través de cultivos de tamización para detectar estos microrganismos multirresistentes. Reportamos el caso de un paciente, con historia de sepsis de origen pulmonar, colonizado por Klebsiella pneumoniae con coproducción de carbapenemasas NDM + KPC y Escherichia coli con carbapenemasa NDM. Este hallazgo es cada vez más frecuente, lo cual implica un reto en su detección y diagnóstico. Se describen características del paciente, procedimientos realizados y hallazgos microbiológicos.

Abstract The constant increase in carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) constitutes a public health problem worldwide, due to the impact generated on the mortality of patients. The gastrointestinal tract is the main reservoir for this microorganism, which is why, rectal colonization becomes an important risk factor for the development of subsequent infections. One of the active epidemiological surveillance strategies is the search for colonized patients through screening cultures, to detect these multi-resistant microorganisms. We report the case of a patient, with a history of sepsis of pulmonary origin, colonized by Klebsiella pneumoniae with co-production of NDM + KPC carbapenemases and NDM carbapenemase-producing Escherichia coli. This finding is more and more frequent, which implies a challenge in its detection and diagnosis. Patient characteristics, procedures performed and microbiological findings are described.

Detección rápida de Enterobacterias productoras de carbapenemasas en hisopados rectales de pacientes neonatos colonizados / Rapid detection of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in rectal swabs of colonized neonatal patients

Resumen Objetivo: Detectar la presencia de Enterobacterias productoras de carbapenemasas en hisopados rectales de neonatos mediante técnica de nefelometría láser y caracterización del tipo de carbapenemasa mediante test inmunocromatográfico. Materiales y Métodos: Estudio descriptivo de corte transversal. Fueron incluidos 57 neonatos, tamizados al ingreso a UCI, mediante hisopado rectal, procesado por nefelometría laser HB&L Carbapenemase (Alifax®) y caracterización del tipo de carbapenemasa por inmunocromatografía rápida RESIST-3 (Coris BioConcept®). Resultados: Encontramos un alto porcentaje de colonización rectal (22.9%) correspondiente a 13 hisopados positivos y 44 (77.1%) fueron negativos por nefelometría láser. Por VITEK 2® se obtuvo identificación de Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenémicos en los 13 aislamientos y el test inmunocromatográfico reveló la presencia de carbapenemasas blaKPC en estos aislamientos. Discusión: Estudios evidencian el aumento de la colonización por microorganismos productores de carbapenemasas en neonatos. Los resultados de este estudio demuestran que un porcentaje significativo de neonatos que ingresan a las Unidades de Cuidado Neonatal se encuentran colonizados con Enterobacterias productoras de carbapenemasas en tracto intestinal. Lo anterior constituye un riesgo potencial para su diseminación y posterior desarrollo de brotes, en donde surge la importancia de implementar estrategias de vigilancia activa como la tamización rectal para la detección oportuna de neonatos colonizados.

Abstract Objective: To detect the presence of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in rectal swabs of neonates by means of laser nephelometry technique and characterization of the type of carbapenemase by immunochromatographic test. Materials and Methods: Descriptive cross-sectional study. 57 neonatal patients were included; They underwent rectal screening upon admission to the ICU, using swabs which were processed by HB&L Carbapenemase laser nephelometry (Alifax®) and characterization of the type of carbapenemase by RESIST-3 rapid immu nochromatography (Coris BioConcept®). Results: We found a high percentage of rectal colonization (22.9%) corresponding to 13 positive swabs and 44 samples (77.1%) were negative by laser nephelome try. Identification of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae was obtained by VITEK 2® in the 13 isolates and the immunochromatographic test revealed the presence of blaKPC carbapenemases in these isolates. Discussion: Studies show increased colonization by carbapenemase-producing microorganisms in neonates. The results of this study demonstrate that a significant percentage of neonates who enter Neonatal Care Units are colonized with Enterobacteriaceae that produce carbapenemases in the intestinal tract. This constitu tes a potential risk for its spread and subsequent development of outbreaks, where the importance of implementing active surveillance strategies such as rectal screening for the timely detection of colonized neonates arises.

Caracterización de bacilos gramnegativos multi-resistentes, aislados en pacientes hospitalizados en instituciones de salud de Barranquilla (Colombia) / Characterization of multiresistant gram-negative bacilli, isolated in patients hospitalized in health institutions in Barranquilla (Colombia)

Resumen Introducción: La resistencia a carbapenémicos en bacilos gramnegativos es un problema de salud pública mundial, debido a que se asocia con altas tasas de mortalidad, aumento en los niveles de resistencia a otros antimicrobianos, elevación en el potencial de diseminación e incremento en los costos de atención en salud. Objetivo: Caracterizar bacilos gramnegativos multirresistentes, aislados en pacientes hospitalizados en instituciones de salud de Barranquilla (Colombia). Material y Métodos: Estudio descriptivo acerca de la caracterización fenotípica y genotípica de la resistencia bacteriana en las infecciones asociadas a la atención en salud, mediada por carbapenemasas en aislados bacterianos enviados por los laboratorios pertenecientes a la red de laboratorios del Departamento del Atlántico. Resultados: La KPC fue la carbapenemasa más frecuente en las Enterobacterales (27,6%), predominando en Klebsiella pneumoniae (13,1%) sola y asociada a otras carbapenemasas. En Pseudomonas aeruginosa predominó la carbapenemasa VIM (32,8%) y la OXA en Acinetobacter baumannii (17,1%). Conclusión: Se encontró una amplia distribución de cepas multi-resistentes productoras de carbapenemasas en instituciones de salud de Barranquilla, las cuales expresaron los siguientes mecanismos de resistencia: KPC, VIM, NDM, OXA.

Abstract Background: The emergence of carbapenem resistant gramnegative bacilli has become a problem of public health worldwide, because it is associated with high mortality rates, increased levels of resistance to other antimicrobials, increased potential for dissemination transition and increase in health care costs. Aim: To characterize multiresistant gram-negative bacilli, isolated in patients hospitalized in health institutions of Barranquilla (Colombia). Methods: A descriptive study was conducted on the phenotypic and genotypic characterization of bacterial resistance in infections associated with health care, mediated by carbapenemases in bacterial isolates sent by laboratories belonging to the laboratory network of the Department of Atlántico. Results: KPC was the most frequent carbapenemase in Enterobacterales (27.6%), predominantly in Klebsiella pneumoniae (13.1%) alone and associated with other carbapenemases. In Pseudomonas aeruginosa, VIM carbapenemase (32.8%) predominated and OXA in Acinetobacter baumannii (17.1%). Conclusion: A wide distribution of multi-resistant strains producing carbapenemases in Atlantic health institutions was found, which expressed the following resistance mechanisms: KPC, VIM, NDM, OXA.

Carbapenemasas en aislamientos de Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenémicos aisladas en hospitales de Chile

Resumen Introducción: La resistencia a carbapenémicos mediada por carbapenemasas en Pseudomonas aeruginosa es un mecanismo importante; sin embargo, la pérdida de la porina OprD continúa siendo el mecanismo más frecuente. Objetivo: Determinar la proporción de aislados de P. aeruginosa, resistentes a imipenem y/o meropenem, productores de carbapenemasas, el tipo de enzima producida y la relación genética entre los aislados. Material y Métodos: Se incluyó 113 aislados resistentes al menos a un carbapenémico, provenientes de 12 hospitales de 9 ciudades de Chile. Adicionalmente se determinó la susceptibilidad a ceftazidima, amikacina, gentamicina, piperacilina/tazobactam, ciprofloxacina y colistina. Se realizó Carba NP y en los aislados positivos (n: 61) se detectó genes de carbapenemasas por RPC. Los aislados fueron tipificados por restricción con SpeI y PFGE. Resultados: No todos los aislados presentan carbapenemasas, y sólo en 61/113 de ellos (54%) se amplificó blaKPC (32) o blaVIM (29). En ninguno de los aislados se encontró co-portación de ambos genes. Los pulsotipos indican que no hay diseminación clonal de los aislados, evidenciando una importante diversidad genética. Conclusiones: Los aislados de P. aeruginosa productores de carbapenemasas, obtenidos en hospitales de Chile, portan genes blaKPC y blaVIM y, en su mayoría, son policlonales. Estos resultados ponen énfasis en la importancia de realizar estudios epidemiológicos con mayor número de aislados que permitan conocer mejor la epidemiología de P. aeruginosa productoras de carbapenemasas en Chile.

Abstract Background: Carbapenem resistance mediated by carbapenemases in Pseudomonas aeruginosa is an important mechanism; however, loss of porin OprD remains as the most frequent. Aim: To determine the proportion of P. aeruginosa isolates, resistant to imipenem and/or meropenem, producing carbapenemases, the type of enzyme produced and the genetic relationship between the isolates. Methods: One hundred and thirteen resistant to at least one carbapenem isolates, obtained in 12 hospitals and 9 cities in Chile were studied. Additionally, susceptibility to ceftazidime, amikacin, gentamicin, piperacillin/tazobactam, ciprofloxacin and colistin was determined. Carba NP was performed and in the positive isolates carbapenemase genes were detected by PCR. The isolates were typified by restriction with SpeI and PFGE. Results: Not all isolates produce carbapenemases, and only in 61/113 of them (54%) the blaKPC (32) or blaVIM (29) was amplified. In none of the isolates was found the coharboring of both genes. The pulsotypes indicated no clonal dissemination of the isolates, evidencing an important genetic diversity. Conclusions: P. aeruginosa isolates producing carbapenemases, obtained in Chilean hospitals carry blaKPC and blaVIM genes and, mostly, are polyclonal. These results emphasize the importance of carrying out epidemiological studies with a greater number of isolates to allow a better understanding of the epidemiology of carbapenemase-producing P. aeruginosa in Chile.

Caracterización molecular de carbapenemasas en el Perú durante el 2019 / Molecular characterization of carbapenemases in Peru during 2019

RESUMEN La resistencia a los carbapenémicos es un problema de salud pública. Este estudio presenta la identificación de enzimas carbapenemasas en Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp. y Acinetobacter spp. presentes en cepas de 30 instituciones prestadoras de servicios de salud del Perú como parte del proceso de control de calidad en diagnósticos. La confirmación fenotípica e identificación enzimática se realizó utilizando la prueba de Blue CARBA y la prueba de sinergia con discos de ácido fenilborónico y ácido etilendiaminotetraacético/ácido mercaptoacético de sodio. Se identificaron 185 cepas con carbapenemasas: 78 en Enterobacteriaceae, 61 en P. aeruginosa y 46 en Acinetobacter spp. Los tipos de carbapenemasas identificadas fueron: blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaVIM, blaOXA-23, blaOXA-24, blaOXA-51 y la coproducción de blaVIM/IMP. Es importante reforzar la promoción del uso racional de antimicrobianos y la vigilancia epidemiológica en los nosocomios del país.

ABSTRACT Resistance to carbapenems is a public health problem. This study presents the identification of carbapenemase enzymes in Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp. present in strains from 30 institutions that provide health services in Peru as part of the quality control process in diagnoses. Phenotypic confirmation and enzymatic identification were performed using the Blue CARBA test and the synergy test with phenylboronic acid and ethylenediaminetetraacetic acid/sodium mercaptoacetic acid discs. 185 strains with carbapenemases were identified: 78 in Enterobacteriaceae, 61 in P. aeruginosa and 46 in Acinetobacter spp. The types of carbapenemases identified were: blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaVIM, blaOXA-23, blaOXA-24, blaOXA-51 and the blaVIM/IMP co-production. It is important to strengthen the promotion of the rational use of antimicrobials and epidemiological surveillance in the country's hospitals.

Caracterización molecular de carbapenemasas en el Perú durante el 2019 / Molecular characterization of carbapenemases in Peru during 2019

RESUMEN La resistencia a los carbapenémicos es un problema de salud pública. Este estudio presenta la identificación de enzimas carbapenemasas en Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp. y Acinetobacter spp. presentes en cepas de 30 instituciones prestadoras de servicios de salud del Perú como parte del proceso de control de calidad en diagnósticos. La confirmación fenotípica e identificación enzimática se realizó utilizando la prueba de Blue CARBA y la prueba de sinergia con discos de ácido fenilborónico y ácido etilendiaminotetraacético/ácido mercaptoacético de sodio. Se identificaron 185 cepas con carbapenemasas: 78 en Enterobacteriaceae, 61 en P. aeruginosa y 46 en Acinetobacter spp. Los tipos de carbapenemasas identificadas fueron: blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaVIM, blaOXA-23, blaOXA-24, blaOXA-51 y la coproducción de blaVIM/IMP. Es importante reforzar la promoción del uso racional de antimicrobianos y la vigilancia epidemiológica en los nosocomios del país.

ABSTRACT Resistance to carbapenems is a public health problem. This study presents the identification of carbapenemase enzymes in Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp. present in strains from 30 institutions that provide health services in Peru as part of the quality control process in diagnoses. Phenotypic confirmation and enzymatic identification were performed using the Blue CARBA test and the synergy test with phenylboronic acid and ethylenediaminetetraacetic acid/sodium mercaptoacetic acid discs. 185 strains with carbapenemases were identified: 78 in Enterobacteriaceae, 61 in P. aeruginosa and 46 in Acinetobacter spp. The types of carbapenemases identified were: blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaVIM, blaOXA-23, blaOXA-24, blaOXA-51 and the blaVIM/IMP co-production. It is important to strengthen the promotion of the rational use of antimicrobials and epidemiological surveillance in the country's hospitals.

Expression analysis of drug-resistant gene (blaOXA-51) in carbapenemases producing Acinetobacter baumannii treated with imipenem/sulbactam combination

Drug-resistant Acinetobacter baumannii is a frightening reality. The aim of this study is to examine the expression profiles of blaOXA-51 gene in carbapenemases producing A. baumannii treated with imipenem/sulbactam combination. Carbapenemases producing A. baumannii was identified among clinical isolates of A. baumannii obtained from patients at Shahid Rajaee hospital, Gachsaran, Iran, from January to June 2018. Synergism testing of imipenem/sulbactam on carbapenemases producing A. baumannii was carried out by broth microdilution method. Eventually, the expression of blaOXA-51 gene was carried out to investigate the inhibitory properties of imipenem/sulbactam combination against carbapenemases producing A. baumannii using quantitative real time RT-PCR. Among A. baumannii isolates, 24% were carbapenemases producing A. baumannii. Imipenem/sulbactam combination revealed synergistic and partial synergistic effect for all tested isolates (FIC= 0.313-0.75). Finally, imipenem/sulbactam combination displayed significant down-regulation of blaOXA-51 gene in carbapenemases producing A. baumannii. Imipenem synergizes with sulbactam against carbapenemases producing A. baumannii by targeting of the blaOXA-51 gene.

Caracterización de carbapenemasas en enterobacterias de muestras de pacientes que acudieron al Hospital General San Juan de Dios de la ciudad de Guatemala durante 2014 y 2015 / Characterization of carbapenemases in Enterobacteriaceae of samples of patients who attended the San Juan de Dios General Hospital in Guatemala City during 2014 and 2015

En salud pública a nivel mundial, la producción de carbapenemasas es actualmente el mayor problema de resistencia antimicrobiana. El objetivo de este estudio fue caracterizar las carbapenemasas en enterobacterias en pacientes que acudieron al Hospital General San Juan de Dios de la ciudad de Guatemala y determinar servicios hospitalarios y tipos de muestras más frecuentes. Se usaron datos de 2014 y 2015 del área de bacteriología del hospital; se realizó una revisión sistemática, selección, ordenamiento y cálculo de frecuencias y porcentajes. En 2014, 165/165 (100 %) de las carbapenemasas fueron de tipo metalo-ß-lactamasas (MBL); en 2015, 90/118 (76 %) MBL y 28/118 (24 %) Klebsiella pneumoniae carbapenemasa (KPC). Klebsiella pneumoniae fue la enterobacteria productora de carbapenemasas (CPE) aislada con más frecuencia, 134/165 (81 %) en 2014 y 82/118 (69 %) en 2015. En 2014 la unidad de cuidados intensivos de neonatos obtuvo el mayor porcentaje de aislamientos de CPE, 30/165 (18 %); en 2015, medicina de hombres fue el servicio con el mayor porcentaje de CPE, 13/118 (11 %). El tipo de muestra más frecuente en 2014 fue sangre, 67/165 (41 %); en el 2015 fue orina, 31/118 (26 %). Los resultados evidencian la persistencia de carbapenemasas tipo MBL y la aparición de nuevos tipos, específicamente carbapenemasas tipo KPC, que destacan la necesidad de actuar urgentemente ante el riesgo que suponen para la salud de la población.

In public health worldwide, carbapenemase production is currently the biggest problem of antimicrobial resistance. The objective of this study was to characterize carbapenemases in Enterobacteriaceae of patients who attended the San Juan de Dios General Hospital in Guatemala City and to determine hospital services and types of samples more frequent. Data from 2014 and 2015 of the bacteriology department of the hospital were used; a systematic review, selection, ordering and calculation of frequencies and percentages was conducted. In 2014, 165/165 (100 %) of the carbapenemases were metallo-ß-lactamases (MBL); in 2015, 90/118 (76 %) MBL and 28/118 (24 %) Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC). Klebsiella pneumoniae was the carbapenemases-producing Enterobacteriaceae (CPE) most frequently isolated, 134/165 (81 %) in 2014 and 82/118 (69 %) in 2015. In 2014 the neonatal intensive care unit obtained the highest percentage in CPE, 30/165 (18 %); in 2015, men's medicine was the service with the highest percentage of carbapenemases, 11/138 (11 %). The most frequent type of sample in 2014 was blood, 67/165 (41 %). In 2015 it was urine, 31/118 (26 %). The results obtained highlight the persistence of MBL-type carbapenemases and the appearance of new types of carbapenemases, specifically KPC. These results underline the need to act urgently in Guatemala in the face of the problems that carbapenemases-producing Enterobacteriaceae pose for the health of the population.

Identificación de los mecanismos resistencia enzimáticos en uropatógenos de pacientes ambulatorios de un hospital público de San Lorenzo, Paraguay; 2015-2019 / Identification of enzyme resistance mechanisms in pathogens from an outpatient clinic in a public hospital in San Lorenzo, Paraguay; 2015-2019

Introducción: El propósito del estudio es determinar en los urocultivos, la prevalencia de los mecanismos enzimáticos de resistencia encontrados in vitro. Materiales y métodos: Se realizó un estudio retrospectivo, de ambos sexos, mayores de 18 años, que acudieron al Consultorio Externo de Clínica Médica y Urgencias por síntomas de infección urinaria. Se incluyeron todos los urocultivos en los que se aislaron uropatógenos con recuento ≥ 105 UFC/mL. Se excluyeron los urocultivos polimicrobianos, los que no contaban con antibiograma o aquellos con datos clínicos incompletos. Resultados: Se identificaron 1031 urocultivos que cumplieron con los criterios establecidos para la realización del estudio. El 56% correspondió al sexo femenino y el 43% al masculino. La edad media de las mujeres fue de 52± 20 años y el de los hombres fue de 62±16 años. Los uropatógenos más frecuentes fueron Escherichia coli 553 (52% en promedio) seguida de Klebsiella pneumoniae con 148 (14% en promedio). Urocultivos de varones: El principal mecanismo de resistencia de Escherichia coli fueron las BLEE, 55 aislamientos (91%); seguida de las MBL, 3 aislamientos (5%) y KPC, 2 aislamientos (3%). En Klebsiella pneumoniae en 53 aislamientos se puedo observar: BLEE, 31 aislamientos (58%); seguida de las KPC 13 aislamientos (25%) y MBL, 9 aislamientos en (16%). Urocultivos en mujeres: Las enzimas de Escherichia coli fueron 81 aislamientos, de los cuales fueron BLEE, 79 aislamientos (97%); seguido de las KPC, 1 aislamiento (1%) y las MBL, 1 aislamiento (1%). En Klebsiella pneumoniae se pudo observar los siguientes mecanismos enzimáticos en base a 35 aislamientos; BLEE, 19 aislamientos (54%), seguida de las KPC, 12 aislamientos (34%) y por último, MBL, 4 aislamientos (13%). Conclusión: En las IVU de nuestro estudio, Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae fueron las principales bacterias que originan resistencia a los antibióticos y la BLEE fue la enzima más frecuentemente identificada en ambos sexos.

Introduction: The objective of this study was to assess frequency of enzymatic resistance mechanisms isolated from community urinary tract infections (UTI) determined in vitro in urine cultures. Objectives: This is a retrospective study, a total of 1031 urine samples were included from patients with urinary tract infection who had consulted at the Outpatient Clinic and Emergencies Services. The following information was recorded, age, sex, urine sample. All urine cultures in which pathogens with a count of ≥ 105 CFU / mL were included. Were excluded polymicrobial urine cultures, those without an antibiogram or those with incomplete clinical data. Results: A total of 1031 urine samples met inclusion criteria, 56% of patients were female and 43% male. The mean age of the women was 52 ± 20 years and in men was 62 ± 16 years. 553 (52%) E. coli and 148 (14%) Klebsiella strains were isolated from community samples. Male urine cultures: The main resistance mechanism of Escherichia coli was ESBLs, 55 isolates (91%); followed by MBL, 3 isolates (5%) and KPC, 2 isolates (3%). In Klebsiella pneumoniae (53 isolates); ESBL, 31 isolates (58%); followed by KPC 13 isolates (25%) and MBL, 9 isolates in (16%). Female urine culture: Escherichia coli enzymes 81 isolates, of which ESBLs were 79 isolates (97%); followed by KPC, 1 isolate (1%) and MBL, 1 isolate (1%). In Klebsiella pneumoniae the following enzymatic mechanisms could be observed based on 35 isolates; ESBL, 19 isolates (54%), followed by KPCs, 12 isolates (34%) and finally, MBL, 4 isolates (13%). Conclusion: The result of our study showed high prevalence of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae causing resistance to antibiotics in culture bacteria from urine samples of patients with UTI, and ESBL was the main ß-lactamase resistance mechanism in Klebsiella and E. coli isolates in both male and female.

Caracterización clínica, epidemiológica y microbiológica de bacteriemias producidas por enterobacterias resistentes a carbapenems en un hospital universitario de Córdoba, Argentina / Clinical, epidemiological and microbiological characterization of bacteremia produced by carbapenem-resistant enterobacteria in a university hospital in Córdoba, Argentina

Resumen Introducción: Las enterobacterias son una causa principal de infecciones del torrente sanguíneo y su resistencia antimicrobiana se encuentra en aumento. Esto lleva a un incremento de la morbilidad-mortalidad y de los costos en la salud pública. Las enterobacterias resistentes a carbapenems representan un grave desafío a nivel global ya que existen escasas opciones terapéuticas disponibles. Objetivo: Caracterización clínico/microbiológica de las bacteriemias resistentes a carbapenémicos observadas en un período de 4 años. Material y Método: Estudio retrospectivo, observacional y descriptivo, sobre las bacteriemias por enterobacterias resistentes y sensibles a carbapenems. Resultados: Se analizó un total de 84 pacientes con bacteriemia por enterobacterias resistentes y sensibles a carbapenems. Entre las resistentes, observamos una mayor proporción de: tratamiento antimicrobiano previo, hospitalización en unidad de terapia intensiva (UTI), inicio de la bacteriemia en UTI y antecedentes de β-lactamasas de espectro extendido. Además, se detectó un amplio predominio de Klebsiella pneumoniae productor de KPC y una mortalidad atribuible de 52,4%. Discusión: El estudio posibilitó profundizar el conocimiento de una enfermedad emergente de elevada mortalidad, en vistas al diseño y aplicación de estrategias de control de infecciones y de esquemas de tratamiento efectivos adaptados a la epidemiologia local.

Abstract Background: Enterobacteriaceae are a major cause of bloodstream infections and their antimicrobial resistance continues to increase. This leads to higher morbidity-mortality rates and public health costs. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae represent a serious challenge globally, since there are few therapeutic options available. Aim: Clinical/microbiological characterization of the carbapenem-resistant bacteremia observed over a period of 4 years. Methods: Retrospective, observational and descriptive study about bacteremia caused by carbapenem-resistant and susceptible Enterobacteriaceae. Results: A total of 84 patients with bacteremia including carbapenem-resistant and susceptible Enterobacteriaceae were analyzed. We found that patients infected with carbapenem-resistant strains presented a higher proportion of: previous antibiotic treatment, hospitalization in intensive care unit (ICU), onset of the bacteremia during hospitalization in ICU and previous infection with extended-spectrum-beta-lactamase producing Enterobacteriaceae. Additionally, we observed a predominance of KPC-producing Klebsiella pneumoniae and an attributable mortality rate of 52.4%. Discussion: This study allowed for a better understanding of an emerging problem with high mortality, which in turn is useful for the design and adoption of infection control strategies and effective treatment regimens adapted to our local epidemiology.

Carbapenemasas en Pseudomonas aeruginosa con susceptibilidad disminuida a los carbapenémicos después de una década, desde VIM a KPC / Carbapenemases in Pseudomonas aeruginosa with decreased susceptibility to carbapenems after a decade: from VIM to KPC

Resumen Introducción: Pseudomonas aeruginosa es relevante en infecciones asociadas a la atención de salud, principalmente cuando presenta resistencia a carbapenémicos. Objetivos: Estudiar la producción de carbapenemasas en P. aeruginosa, con susceptibilidad disminuida a carbapenémicos procesadas en el Laboratorio de Microbiología de la Red de Salud UC-CHRISTUS entre 2014-2015, y compararlas con las cepas estudiadas en 2004-2005. Métodos: Entre enero de 2014 y junio de 2015, se aislaron 459 cepas de P. aeruginosa provenientes de muestras clínicas. La susceptibilidad fue determinada por dilución en agar y a las cepas con susceptibilidad disminuida a carbapenémicos se les realizó test de carbaNP. Las cepas positivas fueron estudiadas por RPC para genes blaVIM, blaVIM-1, blaVIM-2, blaIMP, blaNDM, blaKPC, blaOXA y blaIMI. Se realizó en cepas seleccionadas electroforesis de campo pulsado. Resultados: De las 459 cepas estudiadas, 300 presentaban susceptibilidad disminuida a carbapenémicos (65,3%). De éstas, 183 fueron viables para estudio, correspondientes a 164 pacientes. El test de carbaNP fue positivo en 44 cepas de las 183 cepas (24%). Los genes de resistencia encontrados fueron: blaVIM-2 en 35 cepas, blaKPC-2+VIM-2 en 7 cepas y blaKPC-2 en 2 cepas. En las cepas blaKPC-2 se encontró relación clonal entre ellas. Conclusiones: Un 65,3% de P. aeruginosa presentó susceptibilidad disminuida a carbapenémicos, observándose que la presencia de carbapenemasas no es el principal mecanismo de resistencia. Además, se describe la emergencia en Chile de cepas de P. aeruginosa con carbapenemasas del tipo KPC-2 sola o en combinación con VIM-2.

Abstract Background: Pseudomonas aeruginosa is a relevant infectious agent affecting patients within health care setting; this situation is worsening with the appearance of strains resistance to carbapenems. Aims: To study carbapenemase production in P. aeruginosa with decreased susceptibility to carbapenems processed in the microbiology laboratory of the Health Network UC-CHRISTUS in 2014-2015 and compare them with the strains studied in 2004-2005. Methods: Between January 2014 and June 2015, 459 strains of P. aeruginosa from clinical samples were isolated. Susceptibility was determined by dilution in agar and strains with reduced susceptibility to carbapenems were tested for carbaNP. Positive strains were studied by PCR for blaVIM, blaVIM-1, blaVIM-2, blaIMP, blaNDM, blaKPC, blaOXA and blaIMI genes. Pulsed field electrophoresis was performed on selected strains. Results: From 459 strains studied, 300 had reduced susceptibility to carbapenems (65.3%). Of these, 183 were viable for study, corresponding to 164 patients. The carbaNP test was positive in 44 strains of the 183 strains (24%). The resistance genes found were: blaVIM-2 in 35 strains, blaKPC-2+VIM-2 in 7 strains and blaKPC-2 in 2 strains. In the blaKPC-2 strains clonal relation between them was found. Conclusions: A 65.3% of P. aeruginosa presented decreased susceptibility to carbapenems being the presence of carbapenemases not the main resistance mechanism. In addition, the emergence in Chile of P. aeruginosa strains with bla of the KPC-2 type alone or in combination with VIM-2 is described.

Molecular characterization of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains from a tertiary care center in South India / Caracterización molecular de cepas de Acinetobacter baumannii carbapenem-resistante en un centro de atención terciaria en el sur de la India

Objectives: Carbapenem resistantAcinetobacter baumannii is an important therapeutic and infection control challenge worldwide. In this study, we investigated the prevalence and distribution of molecular mechanisms of resistance among carbapenem resistant A. baumannii species at a tertiary care setting in South India. Materials and Methods: A total of 89 non-duplicate clinical isolates of carbapenem-resistantA. baumannii were collected from critical care units of St. John's Medical College Hospital, Bengaluru, India. Polymerase chain reaction (PCR) was performed to detect blaOXA type carbapenemase blaOXA-51-like, blaOXA-23-like, blaOXA-24-like and bla OXA-58-like, MBL genes blaNDM, blaIMP, and blaVIM genes. Molecular typing of carbapenem-resistant A. baumannii strains was performed by using Rep-PCR. Results: Eighty-seven of the isolates were found to carry the blaOXA-51 gene and 81 (91%) isolates were found to have blaOXA-51-like gene and blaOXA-23, gene. The bla OXA-24 like gene was detected in two isolates of which one also carried blaOXA-51 like and one isolate carried blaVIM coding gene. The prevalence of blaNDM, blaIMP, bla VIM genes was 12(13%),14 (16%) and 57(64%) respectively. Cluster analyses revealed a 90% similarity and were divided into 5 clusters. Most of the isolates containing carbapenemases coding genes grouped under cluster A, C and UC. Considerable heterogeneity was observed within UC cluster indicating circulation of multiple strains of A. baumannii within our institution. Conclusions: Carbapenemase coding blaOXA-23, blaOXA-24 and blaOXA-51 -like were more common than blaVIM and blaNDM. The presence of blaNDM with other genes coding for carbapenemases indicate the ability of the strains to acquire novel genes despite having its share of the blaOXA like carbapenemase.

Objetivos: El Acinetobacter baumannii resistente a Carbapenem es un reto importante en todo el mundo para su tratamiento y para el control de infecciones hospitalarias. Nosotros estudiamos la prevalencia y los mecanismos de resistencia en aislados de un centro de atención terciario, en el sur de la India Materiales y Métodos: Se estudiaron 89 aislados clínicos de A. baumannii recolectados en unidades de cuidado crítico del Hospital St. John's Medical College en Bengaluru, India. Se realizó amplificación por PCR (Reacción en Cadena de Polimerasa) y luego tipificación molecular con la técnica Rep-PCR (PCR de elementos repetitivos palindromicos) para detectar los genes de carbapenemasa blaOXA, blaOXA-51, blaOXA-23, blaOXA-24, blaOXA-58, MBL, blaNDM, blaIMP y blaVIM. Resultados: Se encontraron 87 aislados que llevaban el gen blaOXA-51 y de ellos en 81 (91%) se encontró blaOXA-51 y blaOXA-23. El blaOXA-24 se detectó en dos aislados de los cuales uno de ellos llevaba blaOXA-51 y otro blaVIM. Los genes blaNDM, blaIMP y blaVIM se encontraron en 12 (13%),14 (16%) y 57(64%) de los aislados, respectivamente. El análisis de agrupamiento reveló un 90% de similitud entre los aislados y que podían asignarse a 5 agrupamientos. La mayoría de aislados llevaban genes de carbapenemasas de los grupos A, C y UC. Se observó mucha heterogeneidad dentro del agrupamiento UC indicando que existe circulación de múltiples cepas de A. baumannii dentro de nuestra institución. Conclusiones: Las carbapenemasas que codifican para blaOXA-23, blaOXA-24 y blaOXA-51 son más comunes que blaVIM y blaNDM en nuestra institución. La presencia de NDM con otros genes codificando para carbapenemasas indica la capacidad que tienen este tipo de aislados para adquirir nuevos genes a pesar de contar con blaOXA.

Prevalence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase - and New Delhi metallo-beta-lactamase-positive K. pneumoniae in Sergipe, Brazil, and combination therapy as a potential treatment option

Abstract INTRODUCTION: Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae infection lacks treatment options and is associated with prolonged hospital stays and high mortality rates. The production of carbapenemases is one of the most important factors responsible for this multi-resistance phenomenon. METHODS: In the present study, we analyzed the presence of genes encoding carbapenemases in K. pneumoniae isolates circulating in one of the public hospitals in the city of Aracaju, Sergipe, Brazil. We also determined the best combination of drugs that display in vitro antimicrobial synergy. First, 147 carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates were validated for the presence of blaKPC, bla GES, bla NDM, bla SPM, bla IMP, bla VIM, and bla OXA-48 genes using multiplex polymerase chain reaction. Thereafter, using two isolates (97 and 102), the role of double and triple combinational drug therapy as a treatment option was analyzed. RESULTS: Seventy-four (50.3%) isolates were positive for bla NDM, eight (5.4%) for bla KPC, and one (1.2%) for both bla NDM and bla KPC. In the synergy tests, double combinations were better than triple combinations. Polymyxin B and amikacin for isolate 97 and polymyxin B coupled with meropenem for isolate 102 showed the best response. CONCLUSIONS: Clinicians in normal practice use multiple drugs to treat infections caused by multi-resistant microorganism; however, in most cases, the benefit of the combinations is unknown. In vitro synergistic tests, such as those described herein, are important as they might help select an appropriate multi-drug antibiotic therapy and a correct dosage, ultimately reducing toxicities and the development of antibiotic resistance.

Investigation of carbapenemases and aminoglycoside modifying enzymes of Acinetobacter baumannii isolates recovered from patients admitted to intensive care units in a tertiary-care hospital in Brazil

Abstract INTRODUCTION: Acinetobacter baumannii are opportunistic bacteria, highly capable of acquiring antimicrobial resistance through the production of carbapenemases and aminoglycoside modifying enzymes (AMEs). METHODS: Carbapenemase and AME genes were investigated in A. baumannii recovered from inpatients of a Brazilian hospital. RESULTS: The key genes found were bla OXA-51-like, the association ISAba1- bla OXA-23-like, and the AME genes aph(3´)-VI, aac(6´)-Ib, aac(3)-Ia, and aph(3´)-Ia. Different clusters spread through the institution wards. CONCLUSIONS: The dissemination of bla OXA-23-like and AME-carrying A. baumannii through the hospital highlights the need for improved preventive measures to reduce the spread of infection.